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Fiz esse script (cedilha.sh) pra fazer o c-cedilha (ç) funcionar no Ubuntu 16.04. Como é uma tarefa chata que eu já tive que fazer muitas vezes fica mais fácil pra mim ter um script pra fazer isso e pode ser que seja útil a outras pessoas. Infelizmente é uma solução que exige baixar e executar como root um script da internet. Eu recomendo que você leia o script e entenda o que está acontecendo antes de executá-lo. Esse script altera vários arquivos importantes e ele faz um backup (.bak) desses arquivos.
[bash]wget https://raw.githubusercontent.com/silveira/cedilha.sh/master/cedilha.sh
sudo bash cedilha.sh[/bash]
Por favor, se o script funcionou pra você também, diga nos comentários. Se você não está usando Ubuntu 16.04 e quer testar o script ainda assim, edite o script e remova a verificação no inicio do programa.